萊菔子種子類圓形或橢圓形，略扁，長2～4mm，寬2～3mm。種皮薄，表面紅棕色，黃棕色或深灰棕色，放大鏡下觀察有細密網紋。因子葉縱摺，致使種子一側現數條縱溝，一端有黑色種臍。子葉2片，乳黃色，肥厚，縱摺。氣微，味略辛。

　　以粒大、飽滿、堅實、表面紅棕色，無雜質者為佳。

萊菔子顯微鑒別

　　種子橫切面：最外為1層近方形的表皮細胞，下皮為1層薄壁性的半月形巨細胞，切向達160μm左右;內方為1列柵狀細胞層，其側壁和內壁增厚，木化，呈紅棕色，高10～20μm，寬11μm左右;緊靠柵狀細胞層為頹廢的色素層，內含紅棕色物質;色素層下方為1列長方形、扁平的內胚乳細胞，內含糊粉粒。子葉及胚根細胞中均含糊粉粒及脂肪油。

萊菔子理化鑒別

　　1、 取樣品粉末約1g，置硬質試管內，加氫氧化鈉1小粒，置酒精燈上灼熱，放冷加水2ml使溶解，濾過，取濾液1ml，加5%鹽酸酸化，即有硫化氫產生，遇新制的醋酸鉛試紙，顯有光澤的棕黑色。(檢查異硫氰甙類)

　　2、取亞硝基鐵氰化鈉1小粒，置白瓷板上，加水1～2滴使溶解，加上述樣品濾液1～2滴，顯紫紅色。(檢查異硫氰甙類)

　　3、薄層層析 樣品制備：稱取磨碎的種子2g，加石油醚(60～90℃)20ml室溫浸提脫脂18小時，殘渣揮去石油醚，加甲醇20ml，回流提取8小時，甲醇液濃縮至10ml供點樣。吸附劑：0.66%羧甲基纖維素鈉硅膠G板(上海熒光化學石生產)，濕法鋪板，干燥后，置100℃活化2小時。展開劑：乙酸乙酯-丙酮-甲酸-水(5:3:1:0.5)。顯色劑：碘蒸氣顯色。