一般出現在Black Warrior River水系的上游和下游，杰佛遜、馬歇爾、勞倫斯，沃克爾等地方以及中等大小的小河與寬闊的小溪甚至水壩都是其理想的棲息地。

　　平背麝香龜棲息于水中，是一群非常脆弱的個體，水質的變化會使其生病甚至猝死，近年來，由于環境的不斷惡化，一些河流不可避免的遭受著污水的侵襲，這也導致了平背麝香龜數量不斷下降，國際交易價格不斷攀升。

　　平背麝香龜習慣棲息于中等大小的小河與寬闊的小溪，甚至水壩都是理想的棲息地，雖然平背麝香龜可以生活在不同情況的小溪和湖泊中，他的棲息地更適合于自由流淌的小溪和小河中，并且長有大約2英寸深的水生植被。河面上突起和疊加的巖石都積聚著豐富的軟體動物，淺淺淤泥和堆積物，中等的營養成分以及適宜的細菌數量，適當的水溫、較低的污染，加上不斷有沙子的累積并不會有危害的存在。

　　平背麝香龜害羞、神秘的平背很少曬太陽，偏好于黃昏的微弱陽光和夜晚出來活動，尤其在盛夏時節。在白天幼體比成體更善于活動，雄性比雌性有更大的活動范圍。在一個季節內和一個地區內，更多的成體，公龜和母龜活動的范圍主要保持在20~30米以內。