擬眼斑水龜的外觀比較有特點，尤其是其頭部，就像是長了兩對眼睛一樣，是一塊比較特別的花紋，但是背甲與腹部倒沒什么特點，也沒有特別艷麗的花紋。

　　擬眼斑水龜頭窄，上頜無勾曲，咀嚼面無嵴。頭背側有黑邊黃色的的縱向斑塊，并延伸向頸基，在頭背側形成2個明顯的漏斗狀的眼斑，但眼狀斑中無黑點，這點與眼斑水龜和四眼斑水龜明顯不同，頸背深褐色至黑色，并散布橘紅色和橘黃色的縱紋，頦部及頸的腹面為黃色，散布有模糊的斑點。

　　擬眼斑水龜背甲長100 mm左右。頭背平滑無鱗，灰褐色或黃綠色，有黑褐色蟲紋;枕背兩側各有1或2個眼斑，如每側有兩個眼斑，則彼此界限不清甚至趨于融合，每一眼斑中央有1~3個黑點。背甲略扁，灰褐色或紅棕色，其上密布黑褐色蟲紋。四肢較扁，指趾間全蹼。